Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1LQ6UX01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms