Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms