Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms