Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTR9Q6PD62 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms