Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A1Q6PCB7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A1Q6PCB7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms