Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC4Q6P2E9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms