Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms