Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1DP3Q658K8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1DP3Q658K8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms