Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf57Q5W0N0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms