Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms