Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR78Q5VTH9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms