Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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