Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC122Q5T0U0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC122Q5T0U0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms