Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C6orf141Q5SZD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms