Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms