Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHC1Q5JVL4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms