Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM41BQ5BJD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM41BQ5BJD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms