Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms