Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D3Q587I9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms