Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGO2Q562F6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms