Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN3Q4LDR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN3Q4LDR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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