Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF3Q496Y0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms