Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms