Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR2Q2VWA4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR2Q2VWA4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms