Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms