Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPHKAPQ2M3C7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
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