Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC27Q2M243 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms