Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MSMPQ1L6U9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms