Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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