Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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