Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms