Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1AQ16623 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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