Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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