Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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