Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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