Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TPD52-215ENST00000520795 445 ntTSL 218.73■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-226ENST00000523753 587 ntTSL 418.09■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-218ENST00000521354 785 ntTSL 217.49■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-208ENST00000518517 584 ntTSL 49□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-210ENST00000519250 585 ntTSL 45.56□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.227e-9■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 320.5■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 417.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CNTROB-204ENST00000570782 752 ntTSL 216.75■□□□□ 0.276e-16■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 316.01■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 513.36□□□□□ -0.276e-16■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.486e-16■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.516e-16■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CNTROB-205ENST00000570784 695 ntTSL 311.39□□□□□ -0.596e-16■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 211.22□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-202ENST00000506954 571 ntTSL 48.69□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.74e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.784e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 U2AF2-207ENST00000592867 447 ntTSL 215.3■□□□□ 0.048e-10■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 SH3D19-212ENST00000604440 555 ntTSL 48.29□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.364e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 14e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 HOXA3-203ENST00000518451 541 ntTSL 417.35■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 HOXA4-203ENST00000511914 982 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CANT1-214ENST00000592228 1546 ntTSL 514.02□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 MPZ-202ENST00000476410 878 ntTSL 316.89■□□□□ 0.295e-33■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 MAD1L1-220ENST00000483165 603 ntTSL 416.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 ATXN7L1-209ENST00000481880 870 ntTSL 211.42□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 ATXN7L1-208ENST00000478915 1115 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 ATXN7L1-201ENST00000318724 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-7■■■■■ 35.1
PCBP2Q15366 UBAP2-211ENST00000488443 492 ntTSL 512.15□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35
PCBP2Q15366 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 35
PCBP2Q15366 GABARAP-203ENST00000571129 568 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-13■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CD276-206ENST00000559073 1844 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.247e-16■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CD276-207ENST00000559465 1620 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.337e-16■■■■■ 35
PCBP2Q15366 SLC25A23-204ENST00000593600 834 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 35
PCBP2Q15366 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 315.63■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 MOB1B-203ENST00000502869 760 ntTSL 314.58□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 MOB1B-204ENST00000509041 2056 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 VPS13B-212ENST00000524330 218 ntTSL 59.83□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 BMT2-202ENST00000432572 1271 ntTSL 57.85□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 BMT2-203ENST00000485446 528 ntTSL 53.27□□□□□ -1.891e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 35
PCBP2Q15366 GPX2-202ENST00000553522 1134 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.694e-25■■■■■ 35
PCBP2Q15366 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.944e-25■■■■■ 35
PCBP2Q15366 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-25■■■■■ 35
PCBP2Q15366 PDE4D-201ENST00000309641 2025 ntTSL 1 (best)8.7□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 PRRT2-217ENST00000637425 100 ntTSL 52.02□□□□□ -2.094e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 515.1■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.116e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 511.8□□□□□ -0.526e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.488e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.48e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-221ENST00000521830 580 ntTSL 417.56■□□□□ 0.48e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-211ENST00000520136 468 ntTSL 317.04■□□□□ 0.328e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.328e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-218ENST00000521330 556 ntTSL 416.71■□□□□ 0.278e-11■■■■■ 34.9
PCBP2Q15366 ENDOV-224ENST00000522577 702 ntTSL 316.56■□□□□ 0.248e-11■■■■■ 34.9
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