Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRRQ15256 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRRQ15256 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRRQ15256 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PTPRRQ15256 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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