Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK1Q15118 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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