Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
R3HDM1Q15032 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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