Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms