Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC1AQ14683 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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