Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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