Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms