Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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COL9A2Q14055 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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COL9A2Q14055 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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COL9A2Q14055 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL9A2Q14055 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL9A2Q14055 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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