Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBFBQ13951 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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