Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1SQ13698 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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