Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC1Q13547 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC1Q13547 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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