Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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