Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
XRCC4Q13426 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XRCC4Q13426 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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