Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SP140Q13342 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP140Q13342 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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SP140Q13342 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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SP140Q13342 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP140Q13342 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP140Q13342 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP140Q13342 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP140Q13342 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP140Q13342 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP140Q13342 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP140Q13342 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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